最重要的兵权都在内阁手中。为了对抗文官集团，明朝中后期的皇帝只好倚重宦官集团和锦衣卫这样的天子亲兵。这才有了刘瑾、魏忠贤等大太监的风光一时，太监和锦衣卫也因此在史书中被骂的狗血喷头。

总的来说，在明朝中后期，皇帝虽然有宦官集团帮忙，大多时候还是斗不过文官，生错了时代的正德皇帝，不能认老爸的嘉靖皇帝，只能装哑巴的隆庆皇帝，坚决不上朝的万历皇帝……都被文官欺负的很惨。

按照朱元璋设计的政治体系。皇权本来可以保证足够的权威，皇帝之所以斗不过文官。里面的原因很复杂。

从表面上来说，文官之所以如此强势。是因为他们掌握了舆论和话语权，明朝中后期的皇帝从小就要接受严格的教育，十几年如一日被灌输各种理学思想，对文官集团不敢下狠手，害怕染上道德污点。比如万历皇帝被文官欺负了，长年赌气不上朝，却没有其他的行动，反而让文官的权利越来越大。

从深层次的原因来说，皇权降低是因为政治架构出现了问题。王公勋贵被圈养了，武将处处仰人鼻息，只剩下“士大夫与天子共治天下”，皇帝名义上掌握着最高权力，但是各种施政方针和决策都要通过文官集团执行，宦官集团因为自身素质有限，不足以承担重任，皇帝身边可以信任的人越来越少，干什么事情都要通过文官，被一定程度的架空了。

到了明朝末年，崇祯皇帝上来就把魏忠贤漆里哐啷干掉了，一时间“众正盈朝”，东林党把持朝局。具体到每个人，东林党未必都是祸国殃民的奸臣，但在没有制衡和监督的情况下，国家的方针政策连续出现重大失误，再加上各种天灾，大明王朝迅速走向衰落，形势急剧恶化。

崇祯帝后来也发现情况不对，开始重用曹化淳等太监，但是为时已晚，“万历三大征”的辉煌还在人们的记忆中，大明王朝转眼间就土崩瓦解。崇祯临死前痛呼“诸臣误我”，充满了的懊悔和无奈，把文官集团一竿子打死一船人，全部、彻底的否定。

到了南明时期，武将的地位虽然有所提高，但是整个的政治架构没有变，仍然是文官当政的老一套，如此一来，皇权反而进一步降低……弘光帝为了对抗文官集团，通过权臣马士英和武将联合，和东林党正好打了个平手，略微还占一点上风，隆武帝上台后，在东林党和郑芝龙的双重挤压下，像个受气的小媳妇。

隆武帝登基之后，一直试图改变这种情况，在福建时期就开始扶植南党，对抗东林党和郑芝龙的双重封锁，再加上他血统