13号机开始第三次冲击后果断任由雪风用卡西乌斯之枪将其中断。不仅如此，渚熏甚至将SEELE的基地灌满了毒气杀死了基地内的所有人，这才有了雪风所观察到的画面。

完成这一切的渚熏也很果断的自杀了，作为第一使徒的他明白自己是无法继续在人类的世界活动。而且只有死掉的自己才能保护好碇真嗣，于是渚熏在第三次冲击完结后就在碇真嗣面前自杀了，这给碇真嗣带来了很大的心理阴影，所以返回NERV后一直处于精神恍惚的状态。

可能是给自己的儿子物色儿媳妇，碇源堂让明日香和凌波丽去照顾碇真嗣，雪风对此表示这是个错误啊！明日香就算了，凌波丽的基因是碇唯的基因啊，你就不怕出现什么大问题么！

但比起碇真嗣和凌波丽之间是不是会发生什么大问题，碇源堂更关心的还是碇唯的复活。在SEELE灭亡之后，雪风找到了SEELE手中的死海文书并且召唤出了剩余的使徒将其击杀并且夺去了S2机关后，雪风就按照约定开始复活碇唯。

碇唯的消失是因为操控初号机和初号机融为了一体，所以复活碇唯自然需要初号机。在碇源堂的安排下，初号机被运到了一个秘密基地，随后在真希波和碇源堂的见证下，雪风开始复活碇唯。

瞅了一眼虽然并没有说话，但是空气中却充满了火药味，一个看起来只有十多岁的老阿姨和一个怪大叔竟然争风吃醋，实在是丢人！

不理会两个人，雪风已经来到了初号机的一侧，随着雪风灵能的展开，雪风立刻连接上了初号机的内部，来自于碇唯的意识立刻就和雪风接触了。

“使徒已经全部消灭了，人类已经不再面对第三次冲击的威胁，碇真嗣也成长了很多，我现在要将你带出初号机。”

雪风讲的很简单，一直在初号机内的碇唯明白雪风所说的是真的，所以并没有太多的犹豫和挣扎，碇唯立刻就同意了。

于是一旁的碇源堂和真希波看到初号机的四周发出了一阵淡淡的光芒，两个人不免的开始有点激动了。碇源堂不用说，从碇唯和初号机融合之后，碇源堂所做的一切都是为了能够再见到碇唯，哪怕只是在精神世界见到一面也在所不惜。

而真希波对自己的学姐充满了爱慕，十几年的时间也没有减弱她对碇唯的感情，所以终于可以再一次见到学姐，真希波难得的露出了紧张的表情。只见她不断的检查自己身上的衣服和打扮，完全打扮成了当年前往英国留学前，碇唯给她设计的装扮，真希波也是废了不少小心思