攻陷旅顺之时，以日军为主力的日韩联军正同以农民为主力的东学军作战，虽然南接与北接和解，但东学军毕竟是乌合之众，单同朝鲜政府军打仗，也许不至于失败，可现在，对方是握有近代化武器的日军。

金福用所率领的军团，在公州北方的木川和细城山两地，遭到日韩联军的偷袭，溃散了。

大将全琫准从南方向公州北进。论山到公州之间，东学军漫山遍野，却怎么也攻不下公州。这是日军的近代化武器发挥了威力。

这一时期，在东亚，两个特种战争齐头并进，主角都是日军，这就是中日战争和东学军战争。后者具有浓厚的内战色彩。

说不定什么时候，突然爆发大规模起义，搅得天翻地覆。日军的近代化武器并不是万能的。

朝鲜政府实际上已在日本的控制之下。每当出现抵抗日本的迹象时，公使井上馨就会立即要求澄清并谢罪。亡命日本的朴泳孝、徐光范、徐载弼等人已经复职，自不待言。若不是亲日政府，他们恐怕连一天也站不住。当然，也有人坚决反对。

当时东学军的檄文中有这样的句子：

开化奸党勾结倭国，放逐大院君，篡夺国权……

东学军是反现行体制的，但他们又不希望开化，这也许就是所谓的农民的保守性。他们认为，开化是罪恶，把二十条改革要目强加于朝鲜政府的日本是罪恶之源。声援日本、企图搞开化的人，统统是卖国贼。至于同日本有深刻关系的朴泳孝等复权势力，在东学军看来，完全是反正义的。

东学军号召政府军官兵起义：“我们都是朝鲜人，即使所走的道路不同，但斥倭、斥华之义是相通的。”

就是说，在反日、反清的感情上，作为朝鲜人没有不同之处。

在清军已撤退的今天，朝鲜人的最大敌人应该是日本。

“必须同心协力，不要使朝鲜倭国化！”反对这一口号的朝鲜人大概是没有的。

人心所向，有可能凝聚成一股巨大的力量。现在，这股巨大的力量正逐渐形成。可惜，东学军在战术和战略方面，有些过于幼稚。

受到东学军檄文的感召，一支政府军倒戈，举着白旗朝东学军走来，而东学军竟然对他们开了枪。

公州怎么也攻不下，东学军没有办法，只好撤回论山根据地，准备短暂休整一下。日韩联军似乎看穿了他们的意图，开始进攻。结果，东学军不得不南下，退向全州。

形势一天比一天坏，东学军终于解